黄花梨木与其他木材的特点比较相近，易混淆，尤其是与花梨纹紫檀木。花梨纹紫檀木主产于我国海南岛和两广一带，故有人称之为海南紫檀；又因越南及周边国家也有生长，也称为越南檀。区分二者从以下七点入手。
1、较比重
黄花梨木比重多较水轻，入水多半沉；花梨纹紫檀木质坚重，放入水中即沉水底。
2、辨棕眼
黄花梨木质地比较坚硬细密，棕眼非常小，海南黄花梨基本看不到棕眼；花梨纹紫檀木棕眼较小，呈牛毛纹状和蟹爪状。
3、看色泽
黄花梨木色泽多呈黄色，黃中带红；花梨纹紫檀木的色泽比黄花梨木更深，呈橙红至深琥珀色，部分因年代久远失蜡而呈灰褐色。
4、识鬼脸纹
黄花梨木的鬼脸纹多呈老人头、老人头毛发的纹理；花梨纹紫檀木的鬼脸纹则多呈圆形，有的有嘴有眼，但老人头、老人头毛发形状少见。
5、闻气味
黄花梨木锯断面气味多辛辣，日久变为香气；花梨纹紫檀木锯断面散发出浓浓的蔷薇花梨味，非常独特。
6、刮油质
黄花梨木含油脂较少；花梨纹紫檀木油质较重，用手指轻轻一刮即起油痕。
7、比心材
黄花梨木心材多实心，少空洞；花梨纹紫檀木心空洞比较多，正所谓“十檀九空（心)‘’